数据库内核月报

数据库内核月报 - 2020 / 03

PgSQL · 插件分析 · plProfiler

Author: zhuyuan

插件介绍

在进行postgres的服务端编程的时候,常常会发现pg的函数和存储过程是一个黑盒,内部的任何问题都有可能造成性能瓶颈。通常会遇到以下情况:

  1. 出现问题的语句,其实执行地非常快,但是调用过次数多导致变慢
  2. 随机出现的性能瓶颈问题
  3. 生产系统上出现了性能问题(尽管我们不愿意直接上生产系统排查)

以上的出现的性能问题只能采取人肉分析(分析schema、统计信息、SQL语句)、断点(pldebugger)的形式进行排查,排查时间长且不直观、问题时隐时现(甚至对于问题1,根本无法排查出来),因此需要有一个更好的排查方式,同时具备良好的展示方式,来帮助我们找到性能瓶颈的点。

plprofiler(https://github.com/bigsql/plprofiler)提供了一个简洁的postgres函数和存储过程的性能采集方式,用于发现pg的函数和存储过程性能瓶颈,从而让dba和开发人员能够进行针对性地对函数和存储过程、schema等进行优化。

为方便表达,后面统称 函数和存储过程 为 函数。

基本原理

在执行函数/语句前后加入钩子函数,进入的时候记录时间,出来的时候记录时间,两者相减即可得到该函数/语句的执行时间。

注意一下,这里的时间是Wall-Clock time,即真实时间,区分于CPU时间。例如pg_sleep(10),真实时间为10s,cpu时间只有0.001s。这里,该函数的真实时间为10s。

后续所有的数据分析都会基于这部分数据进行,分析运行时间的基本原理是:
self_time = total_time - children_time

基于该算式可以得到该函数的实际消耗时间。例如上述的pg_sleep(10)函数,它不包含语句粒度的子调用,因此children_time为0s,计算得到self_time是10s。

火焰图

plprofiler使用了火焰图作为其展示方式,需要搭配其python客户端使用,可以自动生成火焰图。

火焰图出自Brendan Gregg之手,感兴趣的话可以了解一下他的博客和书籍

火焰图是一个可视化地进行性能分析的利器。性能问题同样遵循着二八定律,即大部分的性能瓶颈是由少部分的问题导致的,因此,基于这个前提,找到导致大部分瓶颈的少部分问题成为了性能优化的关键。

火焰图
http://www.brendangregg.com/FlameGraphs/cpu-mysql-updated.svg

上图是Brendan Gregg博客的示例,这是一个mysql内核的CPU火焰图。

火焰图是可以用鼠标进行交互的,有需要的话可以点击上述链接,进行交互操作

可以看一下这个火焰图,X轴显示该层的总体堆栈,按字母顺序排序,Y轴显示堆栈深度,从底部的零开始计数。每个矩形代表一个栈帧。矩形越宽,它在堆栈中出现的频率就越高。顶部边缘显示了on-CPU的内容,在它下面是它的父函数。颜色通常不重要,它只是随机选择的,用来以区分矩形。

在该CPU火焰图中,矩形宽度对应着CPU的周期,矩形越宽,代表消耗的CPU周期越多(描述的并不完全准确,因为该图是基于采样的,但是采样足够多,基本上可以认为是正确的)可以观察到该图中大部分的性能消耗主要是在两处row_search_for_mysql函数内,可以点击该函数,继续放大视图查找性能瓶颈点从而发现问题。

发现导致性能瓶颈的头部问题后,就可以针对这些头部问题进行优化操作。大部分情况下,优化完这部分问题后,性能瓶颈就能够得到消除。如果还是存在问题,就重复以上流程,因此一个性能优化的工作可以按照以下范式进行:

1. 发现性能瓶颈
2. 找到头部问题
3. 消除头部问题
4. 重新观测性能表现,如果存在问题,回到1

在plprofiler的火焰图中,区别于CPU火焰图,矩形宽度的含义略有变化,代表的是在该函数内的停留时间,即上面所述的Wall-Clock time。同样区别于CPU火焰图,产生的火焰图可以基于采样也可以基于统计,看在性能分析时候所使用的参数,具体可见官方文档。

  CPU火焰图 plprofiler火焰图
矩形宽度 CPU周期 真实时间
统计形式 采样 采样或统计(取决于参数)

基本使用

这里的例子摘自官方README,先从https://github.com/bigsql/plprofiler获取源码。

准备

首先导出环境变量,为了运行demo,你只需要修改这部分内容:

export PGHOST=localhost
export PGPORT=5432
export PGUSER=postgres
export PGPASSWORD=password
export PGDATABASE=pgbench_plprofiler
export PLPROFILER_PATH=/path-to-plprofiler/
export USE_PGXS=1
export PATH=/path-to-pgsql/bin:$PATH

进入到源码目录下,安装服务端插件和客户端插件。

cd $PLPROFILER_PATH
make install #sudo make install
cd $PLPROFILER_PATH/python-plprofiler
python setup.py install #sudo python setup.py install

创建数据库,创建插件。

psql postgres
> CREATE DATABASE pgbench_plprofiler;
> \c pgbench_plprofiler
> CREATE EXTENSION plprofiler;

准备表、数据和函数。

cd $PLPROFILER_PATH/examples
bash prepdb.sh

进行分析

运行plprofiler命令进行性能分析:

plprofiler run --command "SELECT tpcb(1, 2, 3, -42)" --output tpcb-test1.html

编辑
命令完成后,会进入编辑界面,你可以在这里编辑输出网页的标题、长宽、描述等信息。可以不用编辑,直接退出,在执行命令的路径下,可以看到输出的网页 tpcb-test1.html,使用浏览器打开这个网页。
优化前
网页的最上方是火焰图,下面是函数列表,再下面是各个函数的签名以及执行时间的详细信息,从火焰图中我们可以发现最影响性能的函数是tpcb_fetch_abalance。继而我们可以分析出,是由于没有创建索引导致性能很差。(尽管tpcb_upd_accounts性能也很差,但它有可能只是它的子函数的受害者,我们需要优化完子函数再观察情况)。

我们可以创建索引完成这次优化:

psql
> CREATE INDEX pgbench_accounts_aid_idx ON pgbench_accounts (aid);

再次运行plprofiler命令进行性能分析,得到以下结果:
![优化后]](/monthly/pic/202003/2020-03-zhuyuan-result-after.png)
可以看到火焰图发生了变化,tpcb_fetch_abalance不再是性能瓶颈,新的性能瓶颈出现了。由于优化了tpcb_fetch_abalance,可以在下面看到tpcb_upd_accounts的执行时间也大大缩短了,它确实只是子函数的受害者。

如果符合期望,这次的优化可能就到此为止了。如果仍然不满足,那可以用新的火焰图继续分析出性能瓶颈。

总结:

可以看到plprofiler不能告诉我们该如何去做优化,它只能告诉我们在pg里的一个复杂的函数中,到底是哪一行出现了性能问题,得到这个信息后,我们再针对性地对这一行进行优化,有可能是索引问题,有可能是SQL问题,需要具体问题具体分析。 但是很多时候我们仅仅是难以发现是哪一行,这时候需要使用plprofiler,当发现哪一行存在问题后,问题往往很快就能解决了。

实现分析

钩子函数

plprofiler主要是通过插件的形式,hook函数和存储过程的执行的关键路径进行实现的。
PG内核的说明:src/pl/plpgsql/src/plpgsql.h:1061

结构体为PLpgSQL_plugin,主要有5个钩子函数:

void	(*func_setup) (PLpgSQL_execstate *estate, PLpgSQL_function *func);
void	(*func_beg) (PLpgSQL_execstate *estate, PLpgSQL_function *func);
void	(*func_end) (PLpgSQL_execstate *estate, PLpgSQL_function *func);
void	(*stmt_beg) (PLpgSQL_execstate *estate, PLpgSQL_stmt *stmt);
void	(*stmt_end) (PLpgSQL_execstate *estate, PLpgSQL_stmt *stmt);

func_setup函数在调用函数的时候进行调用,在初始化函数定义的局部参数之前。
func_beg函数在调用函数的时候进行调用,在初始化函数定义的局部参数之后。
func_end函数在调用函数结束的时候进行调用。
stmt_beg函数在调用语句之前进行调用。
stmt_end函数在调用语句之后进行调用。

在开始钩子函数中,会获取当前开始时间、以及哪一行,在结束钩子函数中,会获取当前结束时间,并将该行的信息统计记录下来。

为了完成数据的记录和分析,还有部分辅助的数据结构,包括函数的信息、调用链等。这些数据结构的内容和关系如下:
数据结构

数据收集

数据收集部分以stmt的开始和结束为例。

static void
profiler_stmt_beg(PLpgSQL_execstate *estate, PLpgSQL_stmt *stmt)
{
	profilerLineInfo   *line_info;
	profilerInfo	   *profiler_info;

    /* 检查profiler是否启用 */
	if (!profiler_active)
		return;

    /* plugin_info储存的是profilerInfo信息,即当前函数的执行信息,如果为空,则说明是匿名代码块 */
	/* Ignore anonymous code block. */
	if (estate->plugin_info == NULL)
		return;

	/* Set the start time of the statement */
	profiler_info = (profilerInfo *)estate->plugin_info;
	if (stmt->lineno < profiler_info->line_count)
	{
		line_info = profiler_info->line_info + stmt->lineno;
        /* 在这里记录开始时间 */
		INSTR_TIME_SET_CURRENT(line_info->start_time);
	}

	/* Check the call graph stack. */
	callgraph_check(profiler_info->fn_oid);
}
static void
profiler_stmt_end(PLpgSQL_execstate *estate, PLpgSQL_stmt *stmt)
{
	...

    /* 如果没有新数据,就不进行分析,防止每次都进行分析 */
	/* Tell collect_data() that new information has arrived locally. */
	have_new_local_data = true;

    /* 计算经历的时间,记录最大时间、总时间,增加执行次数 */
	INSTR_TIME_SET_CURRENT(end_time);
	INSTR_TIME_SUBTRACT(end_time, line_info->start_time);

	elapsed = INSTR_TIME_GET_MICROSEC(end_time);

	if (elapsed > line_info->us_max)
		line_info->us_max = elapsed;

	line_info->us_total += elapsed;
	line_info->exec_count++;
}

数据分析

分析部分主要是profiler_collect_data函数,该函数会在func_end结束时运行,意味着每执行一次pl/pgSQL函数会收集一次的数据,或者通过手动触发。

可以看到收集了两部分数据:

  1. 调用图数据,即callGraphEntry,对应了火焰图的原始数据
  2. 行统计数据,即linestatsEntry,对应了每个函数的统计数据
static int32
profiler_collect_data(void)
{
	...
    /* 如果没有新数据,就不进行分析,防止每次都进行分析 */
	if (!have_new_local_data)
		return 0;
	have_new_local_data = false;

    /* 分析前需要获取hash table锁 */
	LWLockAcquire(plpss->lock, LW_SHARED);

    /* 1.将调用图数据分析进入共享内存 */
	hash_seq_init(&hash_seq, callgraph_hash);
	while ((cge1 = hash_seq_search(&hash_seq)) != NULL)
	{
		/* 将cge1导入callgraph_hash,并将相关信息记录进去 */
        ...
		cge2->callCount += cge1->callCount;
		cge2->totalTime += cge1->totalTime;
		cge2->childTime += cge1->childTime;
		cge2->selfTime  += cge1->selfTime;
        
        /* 清空已经记录过的信息 */
        cge1->callCount = 0;
		cge1->totalTime = 0;
		cge1->childTime = 0;
		cge1->selfTime = 0;
        ...
	}

    /* 2.将行统计数据导入共享内存 */
	hash_seq_init(&hash_seq, functions_hash);
	while ((lse1 = hash_seq_search(&hash_seq)) != NULL)
	{
		/* 将cge1导入functions_hash,并将相关信息记录进去 */
        ...
		for (i = 0; i < lse1->line_count && i < lse2->line_count; i++)
		{
            /* 更新每一行的最大执行时间、总执行时间、执行次数 */
			if (lse1->line_info[i].us_max > lse2->line_info[i].us_max)
				lse2->line_info[i].us_max = lse1->line_info[i].us_max;
			lse2->line_info[i].us_total += lse1->line_info[i].us_total;
			lse2->line_info[i].exec_count += lse1->line_info[i].exec_count;
		}
        ...
	}

	...
}

对外接口

对外接口比较多,主要是将数据吐给前端,也比较乏善可陈,仅在这里列出,不做具体分析。

接口名称 IN OUT 描述
pl_profiler_callgraph_local SETOF record OUT stack oid[], OUT call_count bigint, OUT us_total bigint, OUT us_children bigint, OUT us_self bigint Returns the content of the local call graph hash table as a set of rows.
pl_profiler_callgraph_overflow boolean   Return the flag callgraph_overflow from the shared state.
pl_profiler_callgraph_shared SETOF record OUT stack oid[], OUT call_count bigint, OUT us_total bigint, OUT us_children bigint, OUT us_self bigint Returns the content of the shared call graph hash table as a set of rows.
pl_profiler_collect_data integer   SQL level callable function to collect profiling data from the local tables into the shared hash tables.
pl_profiler_func_oids_local oid[]   Returns an array of all function Oids that we have linestat information for in the local hash table.
pl_profiler_func_oids_shared oid[]   Returns an array of all function Oids that we have linestat information for in the shared hash table.
pl_profiler_funcs_source SETOF record func_oids oid[], OUT func_oid oid, OUT line_number bigint, OUT source text Return the source code of a number of functions specified by an input array of Oids.
pl_profiler_functions_overflow boolean   Return the flag functions_overflow from the shared state.
pl_profiler_get_collect_interval boolean   Report pid profiling state.
pl_profiler_get_enabled_global boolean   Report global profiling state.
pl_profiler_get_enabled_local boolean   Report local profiling state.
pl_profiler_get_enabled_pid boolean   Report pid profiling state.
pl_profiler_get_stack text[] stack oid[] Converts a stack in Oid[] format into a text[].
pl_profiler_lines_overflow boolean   Return the flag lines_overflow from the shared state.
pl_profiler_linestats_local SETOF record OUT func_oid oid, OUT line_number bigint, OUT exec_count bigint, OUT total_time bigint, OUT longest_time bigint Returns the content of the local line stats hash table as a set of rows.
pl_profiler_linestats_shared SETOF record OUT func_oid oid, OUT line_number bigint, OUT exec_count bigint, OUT total_time bigint, OUT longest_time bigint Returns the content of the shared line stats hash table as a set of rows.
pl_profiler_reset_local void   Drop all data collected in the local hash tables.
pl_profiler_reset_shared void   Drop all data collected in the shared hash tables and the shared state.
pl_profiler_set_collect_interval boolean seconds integer Turn pid profiling on or off.
pl_profiler_set_enabled_global boolean enabled boolean Turn global profiling on or off.
pl_profiler_set_enabled_local boolean enabled boolean Turn local profiling on or off.
pl_profiler_set_enabled_pid boolean pid integer Turn pid profiling on or off.
pl_profiler_version integer   Get int version.
pl_profiler_versionstr text   Get text version.